燃油燃氣鍋爐在運行的過程中主要注意其鍋爐底部其上下不可以出現其積水的現象，這樣可以在一定程度上有效的防止發生其潮濕以及腐蝕的現象，燃油燃氣鍋爐不允許爐膛噴煙正壓燃燒，這樣非常容易燒壞燃燒器。
燃油燃氣鍋爐的熱裂紋主要實在焊縫冷卻過程中的，在高溫階段多產生的裂紋主要發生在焊縫金屬內，只有少量在近縫區，在進行使用時可以分為結晶裂紋、液化裂紋和多邊化裂紋。
結晶裂紋是很常見的一種，主要出現在含雜質元素較多的碳鋼的焊縫中、單相奧氏體不銹鋼、鋁及其合金等焊接結構中。主要影響因素是焊接拉應力、低熔點共晶（焊縫金屬的化學成分）、焊接接頭過熱的程度。
燃油燃氣鍋爐的運行每隔36個月后應停爐進行全面維修，還要做以下工作：清除著火面上的煙垢，積灰。以及清除鍋爐內部，水冷壁的水垢和泥渣，并用清水沖洗干凈。
還要注意檢查鍋爐焊接鋼板內外有無腐蝕現象，若發生有嚴重缺陷立即修復。如果發現可疑之處，但不影響安全生產時，要及時作出記錄一便日后參考。而且檢查完畢后在著火面涂鍋爐漆，以防腐蝕。
燃油燃氣鍋爐在升火過程中，爐墻、金屬框架，受熱面和爐水的蓄熱是不可避免的，為了減少能源的浪費，可以采取方法減少和回收一部分熱量。停爐作熱備用的鍋爐，要緊閉一切爐門擋板，盡量減少冷風進入，鍋爐各部維持較高溫度。當再次點火時，鍋爐各部的蓄熱量就會減少。
